แจ้งเอกสารไม่ครบถ้วน, ไม่ตรงกับชื่อเรื่อง หรือมีข้อผิดพลาดเกี่ยวกับเอกสาร ติดต่อที่นี่ ==>
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
Wiwaporn Soodsawang. Conformational analysis and flexibility of glycosidic bonds based on melezitose structure by NMR, molecular dynamics, and monte carlo simulations. Master's Degree(Applied Analytical and Inorganic Chemistry). Mahidol University. : Mahidol University, 2008.
Conformational analysis and flexibility of glycosidic bonds based on melezitose structure by NMR, molecular dynamics, and monte carlo simulations
การวิเคราะห์คอนฟอร์มเมชั่นและความยืดหยุ่นของพันธะไกลโคซิดิกที่อยู่บนพื้นฐานโครงสร้างเมลิซิโทสโดยนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซืการจำลองพลศาสตร์และมอนติคาร์โลของโมเลกุล
Name: Wiwaporn Soodsawang
LCSH:
Glycosides
-- Structure
LCSH:
Melezitose
LCSH:
Monte Carlo method
MeSH:
Molecular Conformation
Abstract:
Melezitose, [O-α-D-glucopyranosyl-(1→2)-O-β -D-fructofuranosyl-(3→1)-α-Dglucopyranoside]
is an oligosaccharide consisting of two glycosidic linkages in the
molecule. The three dimensional structures of melezitose in solution were studied by
using experimental NMR measurements and unrestrained molecular dynamics (MD)
simulations in explicit water at 300 K, using the SANDER module of AMBER7
program. The energy minimizations, simulated annealing procedures and MD
simulations were carried out by AMBER force field. The results were shown with the
fluctuation of trajectories resulting in the major and minor conformations of
melezitose, rapidly exchanging in solution.
The conformational flexibility of 10 trisaccharide models based on melezitose
structure were carried out by unrestrained 10 ns MD and Monte Carlo (MC)
simulations in water at 300 K. The results of 10 ns unrestrained MD simulations in
explicit water showed that the solvent has little influence on the conformation of the
entire sugar ring molecule, but it has strong influence on the conformational flexibility
of the glycosidic linkages in the molecule.
Abstract:
เมลิซิโทส, [O-α-D-glucopyranosyl-(1→2)-O-β -D-fructofuranosyl-(3→1)-α-Dglucopyranoside]
เป็นโอลิโกแซคคาไรด์ที่ประกอบด้วยไกลโคซิดิก 2 พันธะในโมเลกุล
โครงสร้างสามมิติของเมลิซิโทสในสารละลายถูกศึกษาจากการทดลอง โดยเทคนิคนิวเคลียร์แมก
เนติกเรโซแนนซ์และการจำลองพลศาสตร์โดยไม่ใส่ restraints ในน้ำที่อุณหภูมิ 300 เคลวิน
SANDER module ของโปรแกรม AMBER 7 ใช้สำหรับกระบวนการทำ energy minimization,
simulated annealing และการจำลองพลศาสตร์ ซึ่งทำการศึกษาโดยใช้ AMBER force field ผล
ที่ได้แสดงการแกว่งกลับไปกลับมาของทิศทางการเคลื่อนที่ของโมเลกุล ทำให้ได้โครงสร้างหลัก
และโครงสร้างรองของเมลิซิโทสที่เคลื่อนที่กลับไปกลับมาอย่างรวดเร็วในสารละลาย
ความยืดหยุ่นของไตรแซคคาร์ไรด์ 10 แบบ โดยมีโครงสร้างอยู่บนพื้นฐานของเมลิซิ
โทส ถูกศึกษาโดยการจำลองพลศาสตร์และมอนติคาร์โลของโมเลกุลในน้ำที่อุณหภูมิ 300 เคลวิน
โดยไม่ใส่ restraints ผลที่ได้จากการจำลองพลศาสตร์แสดงถึงตัวทำละลาย ที่มีอิทธิพลเพียงเล็กน้อย
ต่อโมเลกุลของน้ำตาล แต่ส่งผลกระทบสูงต่อความยืดหยุ่นของพันธะไกลโคซิดิกในโมเลกุล
Mahidol University
Address:
NAKHON PATHOM
Email:
liwww@mahidol.ac.th
Name: Ekasith Somsook
Role:
Thesis Advisors
Created:
2008
Modified:
2553-06-22
Issued:
2010-06-10
วิทยานิพนธ์/Thesis
application/pdf
CallNumber:
TH W834c 2008
eng
DegreeName: Master of Science
Level: Master's Degree
Descipline: Applied Analytical and Inorganic Chemistry
Grantor: Mahidol University
©copyrights Mahidol University
RightsAccess:
ใช้เวลา
-0.608444 วินาที
Wiwaporn Soodsawang
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| Conformational analysis and flexibility of glycosidic bonds based on melezitose structure by NMR, molecular dynamics, and monte carlo simulations
มหาวิทยาลัยมหิดล Wiwaporn Soodsawang | Ekasith Somsook | วิทยานิพนธ์/Thesis |
| Effect of glass and polyacid preparations on the strength of glass ionomer cements for dental applications
มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์. สำนักทรัพยากรการเรียนรู้คุณหญิงหลง อรรถกระวีสุนทร Naruporn Monmaturapoj;Siriporn Tanodekaew;Wiwaporn Soodsawang | บทความ/Article |
Ekasith Somsook